Młodzieżowa sekcja piłkarska macierzystego SKS Bałtyk oraz naszej akademii skupia łącznie grubo ponad 300 zawodników - z czego 325 sama AP (stan na 31.08.2022) - regularnie trenujących pod okiem ponad 20 szkoleniowców. Tworzymy największy klub młodzieżowy w Gdyni. Akademia prowadzi szkolenie początkowe aż do kategorii juniora starszego (Under-18) włącznie. Licząc od 10-latków, wszystkie roczniki rywalizują w rozgrywkach ligowych (jesienią 2023 - 12 drużyn), młodsi uczestniczą w turniejach związkowych (6 drużyn). Naszym domem są obiekty Gdyńskiego Centrum Sportu przy ul. Olimpijskiej 5 w Redłowie, nierozerwalnie związane z historią SKS, który ma za sobą jubileusz 90-lecia działalności. 

AKADEMIA 
Od lipca 2013 r. szkolenie biało-niebieskiej młodzieży odbywa się właśnie pod szyldem specjalnie powołanej w tym celu - autonomicznej, acz współpracującej z macierzystym SKS Bałtyk - Akademii Piłkarskiej. Jej prezesem, od końca 2015 r., jest Mariusz Puchalski, wiceprezesem - Maciej Herman, zawodowo CEO w Lotte Wedel. 

WSPÓŁPRACA
Od lat współpracujemy ze Szkołą Podstawową nr 6 na Obłużu, gdzie od roku szkolnego 2018/19 są już cztery klasy sportowe. Oprócz tego najmłodsze drużyny Bałtyku regularnie korzystają z obiektów szkoły przy ul. Cechowej. W 2022 r. podjęliśmy współpracę z Zespołem Szkół Specjalnych nr 17 na Witominie, gdzie odbywają się zajęcia z gimnastyki oraz ze Szkołą Podstawową nr 33 na Oksywiu. Trenujemy także na boiskach SP 26 przy ul. Wolności w centrum Gdyni i SP 37 na Wiczlinie, naturalnym boisku TKKF Checz na Grabówku oraz sztucznym MKS Ogniwo w Sopocie. 

SUKCESY
Wychowankowie SKS Bałtyk zdobyli cztery medale młodzieżowych mistrzostw Polski - jeden srebrny i trzy brązowe. Największy sukces osiągnęła drużyna Adama Adamusa w 1982 r. W rozegranym w Tarnowie finale MP U-19 gdynianie przegrali z Wisłą Kraków 2:4, ale mogli cieszyć się tytułem wicemistrzowskim. 20 lat wcześniej Roman Nowacki, ojciec Zbigniewa, jednego z najlepszych piłkarzy SKS w historii, wprowadził juniorów na najniższy stopień podium. W półfinałowym dwumeczu biało-niebiescy nie dali rady Legii Warszawa i podzielili się brązem z Odrą Opole. W 1977 r., pod wodzą Henryka Filipiaka, juniorzy również sięgnęli po brązowy medal MP U-19, tyle że decydowała o tym zwycięska rywalizacja z Zagłębiem Konin (2:0 i 2:2). I wreszcie w 2000 r., podczas turnieju finałowego MP U-17 w Bielsku-Białej, podopieczni Mieczysława Gierszewskiego pokonali Amikę Wronki 3:0 w meczu o trzecie miejsce. Drużyna rocznika 1983 dokonała więc tego, co na wyciągnięcie ręki miał team B. Dryla latem... 1983 r. Juniorzy młodsi SKS przegrali wówczas brąz w konfrontacji ze Śląskiem Wrocław. 

OSTATNIE LATA
Na początku XXI w. nastoletni piłkarze Bałtyku odgrywali znaczącą rolę w rozgrywkach Pomorskiej Ligi Juniorów. Wygrywali ligę U-19 w latach 2001, 2002 i 2003, za każdym razem przebijając się do ćwierćfinałów MP, natomiast w kategorii juniorów młodszych SKS triumfował w sezonie 1999/2000, co wkrótce zaowocowało wspomnianym sukcesem w finałach MP U-17. W następnych edycjach Bałtyk zajmował na Pomorzu drugie miejsca (2001 i 2002).
W 2009 r. I zespół SKS, pod wodzą trenera Jastrzębowskiego, wygrał III Ligę Bałtycką i awansował do II ligi Zachód mając w składzie dziesięciu wychowanków. Powrót na szczebel ogólnopolski, po trwającej 13 lat banicji na pomorskich boiskach, ożywił działalność sekcji młodzieżowej. W 2011 r. Bałtyk wygrał rozgrywki na Pomorzu i walczył o prawo gry w turnieju finałowym MP do lat 17. Po wyeliminowaniu KSZO Ostrowiec Św. drużyna Karola Złonkiewicza nie sprostała - jak w 1962 r. - Legii Warszawa, późniejszemu wicemistrzowi kraju.
W 2013 r. Bałtyk awansował do nowo powstałej Centralnej Ligi Juniorów (po trzy kluby z każdego województwa), która zastąpiła Młodą Ekstraklasę. Pod kierunkiem Marcina Martyniuka gdynianie zajęli bezpieczne ósme miejsce w grupie B, lecz stracili miejsce w CLJ z powodu kolejnej reformy rozgrywek. Od 2015 r. zespół U-19 pełni rolę bezpośredniego zaplecza III-ligowej "jedenastki" SKS Bałtyk i występuje w rozgrywkach seniorskich. W sierpniu 2017 - po dwóch kolejnych awansach po kierunkiem Jerzego Jastrzębowskiego - juniorski Bałtyk II zadebiutował w V lidze. Późną jesienią 2017 zespół U-17, prowadzony przez Krzysztofa Wesołowskiego i oparty na roczniku młodszym (2002), uczestniczył w barażu o awans do CLJ, lecz nie sprostał Bałtykowi Koszalin. Na mecie sezonu 2018/19 drużyna Bałtyku AP - pod wodzą Marka Marciniaka i po udanych barażach - awansowała do pomorskiej ligi U-17, w której zajęła miejsce SKS Bałtyk (w macierzystym stowarzyszeniu pozostały zespoły III i V ligi oraz U-19).
Przed sezonem 2020/21 r. akademia zgłosiła do rozgrywek kolejną drużynę (U-18).  Wiosną 2021, właśnie za sprawą rocznika 2003 (trener Michał Połomski), zadebiutowaliśmy w Lidze Makroregionalnej U-19 (pod CLJ).
Sezon 2022/23 był dla nas rekordowy - do rozgrywek Pomorskiego ZPN zgłosiliśmy 18 drużyn, co powtórzyliśmy w edycji 2023/24. 

Aktualizacja: 2.09.2023